小粉药和多菌灵的区别在于类型不同、外观不同、作用机理不同。
类型：小药粉属于噻唑酰胺类杀菌剂，多菌灵属于广谱性杀菌剂。
外观：小药粉呈白色粉末状固体，多菌灵呈白色结晶状固体。
作用机理：小药粉在真菌三羧酸循环中抑制琥珀酸脱氢酶的合成，多菌灵可干扰病原菌的纺锤体的正常形成，抑制细胞分裂。
一、类型不同
1、小药粉：是一种有机化合物，也叫噻氟菌胺，属于噻唑酰胺类杀菌剂，具有特效性和强内吸传导性。
2、多菌灵：是一种广谱性杀菌剂，也叫棉萎灵，可用作土壤处理、种子处理、叶面喷雾。
二、外观不同
1、小药粉：呈白色粉末状固体，在水中的溶解度为1.6毫克/升。
2、多菌灵：呈白色结晶状固体，原药是一种棕色粉末。化学性质较稳定，但在水碱性溶液中会缓慢分解。
三、作用机理不同
1、小药粉：在真菌三羧酸循环中抑制琥珀酸脱氢酶的合成，从而达到杀菌效果。
2、多菌灵：可干扰病原菌有丝分裂过程中的纺锤体的正常形成，抑制细胞分裂，从而达到杀菌效果。
四、防治范围不同
1、小药粉：对于丝核菌属、柄锈菌属、黑粉菌属、腥黑粉菌属、伏革菌属、核腔菌属等真菌具有良好的防效，对于担子菌纲真菌引起的病害有特效。
2、多菌灵：对于子囊菌、担子菌、半知菌等多种致病菌具有良好的防效，对卵菌、长蠕孢菌、链格孢菌以及细菌无效。
五、使用方法不同
1、小粉药：每株植物使用1-2克小粉药，撒施在盆土表面或埋在盆中即可。撒施时，用药后要覆盖一层土壤。
2、多菌灵：在配制花卉栽培土壤时，按照适当比例将多菌灵以及土壤混合均匀即可。之后如果花卉出现真菌性病害，可将多菌灵稀释后喷洒或浇灌防治。
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